João Filipe Matos é Professor Catedrático Jubilado da Universidade de Lisboa, doutorado e agregado em educação.
Coordenou o programa de doutoramento FCT Aprendizagem Enriquecida com Tecnologias e Desafios Societais, bem como diversos cursos de Mestrado, nomeadamente em Educação e Tecnologias Digitais.
Dirigiu o e-Learning Lab da Universidade de Lisboa e o Centro de Competência em Tecnologias e Inovação do Instituto de Educação.
Entre 1984 e 2015 lecionou nas Universidades de Lisboa, Madeira, Açores, Cabo Verde, Universidade Católica e Instituto Interuniversitário de Macau, em diversos cursos no domínio da utilização das tecnologias digitais na educação, da educação matemática e das metodologias de investigação.
Foi presidente do International Group for the Psychology of Mathematics Education.
Colabora desde 1988 com o Ministério da Educação, nomeadamente com a DGE, em diversos projetos ligados à cooperação com Cabo Verde e à utilização de tecnologias digitais na educação.
É atualmente Professor Catedrático Convidado da Universidade Lusófona.